包庇罪是指明知是有罪的人而为其作假证明包庇的行为。徇私舞弊不移交刑事案件罪与包庇罪的界限主要有：一是犯罪主体不同，本罪的主体是特殊主体，即行政执法人员，而包庇罪的主体是一般主体；二是侵犯的客体不同，本罪侵犯的客体是复杂客体，既包括司法机关的刑事司法活动，又包括行政执法机关报的行政执法活动，而包庇罪侵犯的客体是一般客体，即侵犯的只是司法机关的刑事司法活动；三是犯罪的客观方面不同，本罪的客观方面表现为徇私舞弊，把应当移交司法机关追究刑事责任的刑事案件不移交，情节严重的行为，而包庇罪的客观方面表现为作虚假证明包庇犯罪分子的行为。