协助与组织卖淫罪的共犯较易混淆。但掌握了相关司法解释的精神，二者就不难区分了。
最高人民法院最高人民检察院印发《关于执行＜全国人民代表大会常务委员会关于严禁卖淫嫖娼的决定＞的若干问题的解答》的通知对此进行了专门解释：“二、怎样认定组织他人卖淫罪？根据《决定》第一条第一款的规定，组织他人卖淫罪，是指以招募、雇佣、强迫、引诱、容留等手段，控制多人从事卖淫的行为。本罪的主体必须是卖淫的组织者，可以是几个人，也可以是一个人，关键要看其在卖淫活动中是否起组织者的作用。在组织他人卖淫的犯罪活动中，对被组织卖淫的人有强迫、引诱、容留、介绍卖淫行为的，应当作为组织他人卖淫罪的量刑情节予以考虑，不实行数罪并罚。如果这些行为是对被组织者以外的其他人实施的，仍应当分别定罪，实行数罪并罚。三、怎样认定协助组织他人卖淫罪？根据《决定》第一条第二款的规定，协助组织他人卖淫罪，是指在组织他人卖淫的中起帮助作用的行为。如充当保镖、打手、管帐人等。依照《决定》第一条第二款的规定，协助组织他人卖淫的行为，有具体的罪状和单独的法定刑，应当确定为独立的罪名，适用单独的法定刑处罚，不适用总则第二十四条关于的处罚原则。”
97年新刑法第358条关于“组织卖淫罪和”是由该全国人大决定中“组织他人卖淫罪和协助组织他人卖淫罪”演变过来的，因此最高法院该通知中的精神应当仍然适用。
从该通知可以看出，二者的主要区别在于：组织卖淫罪客观表现为“以招募、雇佣、强迫、引诱、容留等手段，控制多人从事卖淫的行为”，而协助组织卖淫罪客观表现为“在组织他人卖淫的共同犯罪中起帮助作用的行为。如充当保镖、打手、管帐人等。”
从该通知的内容还看出，协助组织卖淫罪有具体地罪状和单独的法定刑，应当确定为独立的罪名，适用单独的法定刑处罚，不适用刑法总则关于从犯的处罚原则。