拘留三天是否会有案底，因情况而定：如果是行政拘留并不会留有案底，因为行政拘留是违反了治安管理法所作出的处罚；如果是刑事拘留，就会留有案底；犯罪的时候不满十八周岁，被判处五年以下刑罚的，应当对相关犯罪记录予以封存；如果是司法拘留，虽然不会留有案底，但是会影响政审。

【法律解析】

拘留的条件
1、拘留的对象是现行犯或者是重大嫌疑分子。现行犯是指正在实施犯罪的人，重大嫌疑分子是指有证据证明具有重大犯罪嫌疑的人；
2、具有法定的紧急情形之一，例如正在预备犯罪、实行犯罪或者在犯罪后即时被发觉的，或者被害人或者在场亲眼看见的人指认他犯罪的。

【法律依据】

《中华人民共和国》第一百条 【前科报告制度】依法受过刑事处罚的人，在入伍、就业的时候，应当如实向有关单位报告自己曾受过刑事处罚，不得隐瞒。
犯罪的时候不满十八周岁被判处五年有期徒刑以下刑罚的人，免除前款规定的报告义务。